CCDC180

CCDC180
Ідентифікатори
Символи	CCDC180, BDAG1, C9orf174, KIAA1529, coiled-coil domain containing 180, CFAP76, FAP76
Зовнішні ІД	MGI: 2685871 HomoloGene: 117988 GeneCards: CCDC180
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100499483	381522
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000035539
UniProt	Q9P1Z9	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_020893 NM_001348010	NM_198660
RefSeq (білок)	NP_001334939 NP_065944	н/д
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 4: 45.89 – 45.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCDC180 (англ. Coiled-coil domain-containing protein 180) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 646 амінокислот, а молекулярна маса — 191 100.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWHGNHVQPG		ATHRPNQGLE		MLQGLGIGMK		AFHNFNYFLF		FYNVLLGLGA
CLSRLLISCL		LGMWLIARID		RTIMQSGYEG		ADMGFSAWIG		MLYMDHYHIN
PVLVSFCHIL		ITNHREKKLQ		QSTKYWCLNQ		SAESLRICAM		RGGENRPPAR
VQSSSEELEL		RHQSLDAFPG		RRLPGRGIQP		AAKMSSVGKV		TQVPNGKAYQ
QIFQAEVQLV		HSLAATRKRA		AERSVTLKSG		RIPMMKKVET		PEGEVMSPRQ
QKWMHSLPND		WIMENPVLHR		EKERAKREKA		RESENTIAAR		EVRGLMDTIV
PEKISTSTFQ		RQAEHKRKSY		ESALASFQEE		IAQVGKEMEP		LIVDTGGLFL
KKLTESDEEM		NRLFLKVEND		TNLEDYTIQA		LLELWDKVAG		RLLLRKQEIK
ELDEALHSLE		FSRTDKLKSV		LKKYAEVIEK		TSYLMRPEVY		RLINEEAMVM
NYALLGNRKA		LAQLFVNLME		STLQQELDSR		HRWQGLVDTW		KALKKEALLQ
SFSEFMASES		IHTPPAVTKE		LEVMLKTQNV		LQQRRLKHLC		TICDLLPPSY
SKTQLTEWHS		SLNSLNKELD		TYHVDCMMRI		RLLYEKTWQE		CLMHVQNCKK
QLLDWKAFTE		EEAETLVNQF		FFQMVGALQG		KVEEDLELLD		KSFETLADQT
EWQSSHLFKY		FQEVVQLWEA		HQSELLVQEL		ELEKRMEQHR		QKHSLESQVQ
EAHLDRLLDQ		LRQQSDKETL		AFHLEKVKDY		LKNMKSRYEC		FHTLLTKEVM
EYPAIMLKEL		NSYSSALSQY		FFVREIFEQN		LAGEVIFKFR		QPEAHEKPSQ
KRVKKLRKKQ		GSKEDMTRSE		ESISSGTSTA		RSVEEVEEEN		DQEMESFITE
EVLGQQKKSP		LHAKMDESKE		GSIQGLEEMQ		VEREGSLNPS		LNEENVKGQG
EKKEESEEED		EKEEEEEEEK		LEEEKEEKEA		QEEQESLSVG		EEEDKEEGLE
EIYYEDMESF		TISSGNTYFV		FVPLEEEHCR		KSHSTFSAMF		INDTSSAKFI
EQVTIPSRLI		LEIKKQLFSE		GGNFSPKEIN		SLCSRLEKEA		ARIELVESVI
MLNMEKLENE		YLDQANDVIN		KFESKFHNLS		VDLIFIEKIQ		RLLTNLQVKI
KCQVAKSNSQ		TNGLNFSLQQ		LQNKIKTCQE		SRGEKTTVTT		EELLSFVQTW
KEKLSQRIQY		LNCSLDRVSM		TELVFTNTIL		KDQEEDSDIL		TSSEALEEEA
KLDVVTPESF		TQLSRVGKPL		IEDPAVDVIR		KLLQLPNTKW		PTHHCDKDPS
QTGFKRHRCQ		PENSGKKAVP		SASATSAGSL		QTTHPPLSHS		FTPHPKPNKM
ERKYRVLGDK		PPPAAEDFKG		IILTLLWESS		ENLLTVAEEF		YRKEKRPVTR
PDCMCDTFDQ		CAENISKKIL		EYQSQANKYH		NSCLIELRIQ		IRRFEELLPQ
VCWLVMENFK		EHHWKKFFTS		VKEIRGQFEE		QQKRLEKRKD		KNAQKLHLNL
GHPVHFQEME		SLHLSEEERQ		EELDSMIRMN		KEKLEECTRR		NGQVFITNLA
TFTEKFLLQL		DEVVTIDDVQ		VARMEPPKQK		LSMLIRRKLA		GLSLKEESEK
PLIERGSRKW		PGIKPTEVTI		QNKILLQPTS		SISTTKTTLG		HLAAVEARDA
VYLKYLASFE		EELKRIQDDC		TSQIKEAQRW		KDSWKQSLHT		IQGLYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9